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論文資訊
- 類型:已發表論文
- 日期:2022-09-02
摘要
馬鈴薯Y病毒(PVY)是一種重要的植物病原體,其宿主範圍包括馬鈴薯、菸草、番茄和辣椒等重要經濟作物。 PVY 提供三種主要菌株(PVYO、PVYN 和 PVYC)和幾種重組形式。 PVY在世界範圍內分佈,但促進和維持其種群結構和遺傳多樣性的機制仍不清楚。在這項研究中,我們使用了來自世界各地收集的分離株的 77 個完整 PVY 基因組。在消除資料集中重組的影響後,我們使用貝葉斯技術來研究地理和宿主物種對 PVY 族群結構和動態的影響。我們也進行了選擇和共變分析來識別進化相關的胺基酸殘基。我們的結果表明,地理和宿主驅動的適應解釋了 PVY 的多樣化。此外,淨化選擇是推動PVY進化的主要力量,儘管有一些跡象表明正選擇!作用解釋了不同菌株的多樣化。有趣的是,對 P3N-PIPO(最近描述的馬鈴薯病毒屬基因)的分析似乎顯示出所分析的分離株之間的長度可變,並且這種可變性部分地由宿主驅動的適應來解釋。