本頁只刊出中文翻譯與中文說明;英文原文請見下方原文連結。
原文連結
論文資訊
- 類型:已發表論文
- 日期:2022-09-02
摘要
馬鈴薯Y病毒(PVY)是一種重要的植物病原體,宿主範圍廣泛,包括馬鈴薯、菸草、番茄和辣椒等。 PVY 的外殼蛋白 (CP) 常用於菌株分類的系統發育研究。在這項研究中,我們使用了來自世界各地收集的分離株的 292 個 CP 序列庫。在檢測和移除重組序列後,我們應用貝葉斯技術來研究地理和宿主物種對CP族群結構和動態的影響。最後,我們進行了選擇和共變分析,以確定參與適應的特定胺基酸。我們的結果表明,PVY CP 多樣化在很大程度上是由地理和宿主驅動的適應造成的。胺基酸位置檢測為正選濃縮在蛋白質的 N 端區域。這些選定的位置中的一些可能會區分菌株,並且在較小程度上區分馬鈴薯和非馬鈴薯分離株。