聖塔非研究所

摘要 不同表型的演化既涉及分子交互作用網絡,也受到分子交互作用網絡的限制

2024-03-12 · 已發表論文 · 更新 2026/03/18 下午02:45

摘要 不同表型的演化既涉及分子交互作用網絡,也受到分子交互作用網絡的限制。當這些網絡影響表現模式時,我們稱它們為基因調控網絡(GRN)。在這裡,我們開發了一個類似於準物種理論的 GRN 演化模型,該模型本身本質上是從經典群體遺傳學擴展到多個基因座的突變選擇平衡模型。透過這個 GRN 模型,我們證明了在廣泛的選擇壓力下,動態收斂到 GRN 上的平穩分佈。接下來,我們從第一原理出發…

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論文資訊

  • 類型:已發表論文
  • 日期:2024-03-12

摘要

不同表型的演化既涉及分子交互作用網絡,也受到分子交互作用網絡的限制。當這些網絡影響表現模式時,我們稱它們為基因調控網絡(GRN)。在這裡,我們開發了一個類似於準物種理論的 GRN 演化模型,該模型本身本質上是從經典群體遺傳學擴展到多個基因座的突變選擇平衡模型。透過這個 GRN 模型,我們證明了在廣泛的選擇壓力下,動態收斂到 GRN 上的平穩分佈。接下來,我們從第一原理出發,展示了平衡時 GRN 的頻率如何與基因型網路的拓撲相關,特別是透過稱為特徵向量中心性的特定網路中心性度量。最後,我們確定了 GRN 的結構特徵,這些特徵有利於響應一系列選擇性環境和突變約束。我們的工作將 GRN 進化與準物種理論聯繫起來,從而與經典種群遺傳學聯繫起來,為觀察到的 GRN 響應各種進化力量而進化的分佈提供了機械解釋,並展示瞭如何從簡單的進化規則中產生復雜的適應度景觀。