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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2024-03-12
摘要
在研究某些時間過程時使用縱向資料的一個主要挑戰是，速度和動態的差異可能會掩蓋過程之間的相似性。就縱向微生物組數據而言，這可能會阻礙描述個體的共同時間趨勢或利用時間資訊來更好地理解微生物組與宿主之間的聯繫的努力。應對這項挑戰的一個可能的解決方案在於「時間對齊」領域——一種最佳對齊從速度可能變化的過程中獲得的縱向樣本的方法。在這項工作中，我們研究了基於比對的分析在微生物組領域的使用，重點是嬰兒出生後第一年的微生物組數據。我們的分析圍繞著兩個主要用例：首先，使用總體比對得分作為微生物組發育軌跡之間相似性的衡量標準，並表明該衡量標準可以捕獲個體之間的生物學差異。其次，利用比對中的樣本對之間獲得的特定匹配來突出顯示速度和時間動態的變化，表明它可以用於根據微生物組預測嬰兒的年齡並揭示發育遲緩。總而言之，我們的研究結果為使用時間對齊作為未來縱向微生物組研究中重要且有益的工具提供了概念驗證。