聖塔非研究所

摘要 準最佳配對圖 (qBMG) 是一類遺傳性的有向、正確頂點著色的圖

2024-03-12 · 已發表論文 · 更新 2026/03/18 下午03:30

摘要 準最佳配對圖 (qBMG) 是一類遺傳性的有向、正確頂點著色的圖。它們作為最佳匹配圖的概括在數學系統發生學中自然出現,它形式化了多個物種(頂點顏色)中基因(頂點)的進化最接近相關性的概念。它們可以透過有根樹來解釋,樹的葉子對應於頂點。與 BMG 相比,qBMG 僅代表有限系統發育距離內的最佳匹配。我們提供了 qBMG 的表徵,這些特徵產生了多項式時間識別演算法,並將 BM…

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論文資訊

  • 類型:已發表論文
  • 日期:2024-03-12

摘要

準最佳配對圖 (qBMG) 是一類遺傳性的有向、正確頂點著色的圖。它們作為最佳匹配圖的概括在數學系統發生學中自然出現,它形式化了多個物種(頂點顏色)中基因(頂點)的進化最接近相關性的概念。它們可以透過有根樹來解釋,樹的葉子對應於頂點。與 BMG 相比,qBMG 僅代表有限系統發育距離內的最佳匹配。我們提供了 qBMG 的表徵,這些特徵產生了多項式時間識別演算法,並將 BMG 識別為無色沉的 qBMG。此外,雙色 qBMG 的特徵是滿足三個簡單局部條件的有向圖,其中兩個先前已經出現過,即 Das 等人意義上的雙傳遞性。 (2021) 和外部鄰域的類似層次結構,即對任兩個頂點 x 和 y,N(x) n N(y) E {N(x), N(y), 0}。進一步的結果表徵了可以用二元系統發育樹解釋的 qBMG。