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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2024-03-12
摘要
透過微生物物種的連續入侵來組裝微生物群落的實驗研究具有挑戰性。在這裡，我使用多個物種的基因組規模代謝模型來模擬群落組裝。每個這樣的模型都代表了一個物種用來從環境中的營養物質中構建生物質的所有已知的生化反應。這種模型中的物種相互作用源於最初的生化原理，要么通過對環境營養物的競爭，要么通過對常駐物種排泄的代謝副產品的交叉餵養。我使用這些模型研究了 250 個群落組裝序列。在每一個這樣的序列中，群落都會透過連續的物種入侵而改變。在 250 個組裝序列中，群落的物種變得更加豐富，並且更能抵抗入侵。對建設性和破壞性入侵（導致物種滅絕的入侵）的抵抗力與高群落生產力、高生物量和低濃度未使用的碳有關。對營養物質的競爭超過了交叉餵食對個體物種生長速度的影響。在 250 個組裝序列期間出現的所有群落組成的群落組裝網路中，某些群落偶然出現的頻率比預期的要高。其中包括具有高生物量的抗入侵「吸引子」群落，它們在群落組裝後期出現，並因其抗入侵性而優先持續存在。基因組規模的代謝模型可以揭示獨立於常駐物種和環境的微生物群落的一般特性。