本頁只刊出中文翻譯與中文說明；英文原文請見下方原文連結。
原文連結
論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2025-04-15
摘要
生物相關性是行為、族群結構和性狀演化研究中的關鍵考慮因素。除了親子關係之外，譜系並不能完美地捕捉相關性。血統相同 DNA 片段 (IBD) 的數量和長度可產生最精確的相關性估計。在這裡，我們利用不同的方法從低深度全基因組重定序資料中估計 IBD 片段，以證明解決自由生活動物中相關性的精細尺度梯度的可行性和價值。主要使用來自恒河猴 (Macaca mulatta) 群體的 4 至 6 倍深度數據和長期譜系數據，我們表明，即使在 0.5 倍測序深度下，我們也可以高精度推斷整個基因組中 IBD 片段的數量和長度。與基於模擬的預期一致，所得估計結果顯示親屬類別內遺傳相關性有顯著差異，導致親屬類別之間的重疊分佈。透過將基於 IBD 的估計值與基於譜系和短串聯重複的方法進行比較，我們表明 IBD 估計更可靠，並提供了有關親屬關係的更詳細資訊。推斷的 IBD 片段也識別了譜系中未出現的隱密遺傳親屬，並揭示了女性相對於男性的重組率較高，這使得大多數近親母系和父系親屬能夠僅透過基因型數據來區分。我們的發現代表了研究自然族群遺傳相關性的預測因子和後果的能力的突破，有助於我們了解野生族群結構的基本組成部分。