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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2026-03-12
摘要
在愛滋病毒預防試驗中，準確估計參與者感染愛滋病毒的時間對於確定感染時的抗體水平是必要的。抗體介導的預防 (AMP) 研究表明，被動施用廣泛中和抗體可以防止中和敏感病毒感染 HIV。我們開發了一個管道，用於使用診斷和病毒序列數據來估計 AMP 研究參與者中可檢測到的 HIV 感染 (DDA) 的日期。使用貝葉斯策略，結合三個資料流（REN [rev/vpu/env/Delta nef] 序列、GP [gag/Delta pol] 序列和診斷），其中它們的 95% 可信區間根據預先指定的標準和決策規則重疊。我們使用兩項前瞻性急性 HIV 獲得性隊列研究（FRESH 和 RV217）中 41 名參與者的 PacBio 病毒序列數據評估了 AMP 管道的性能，每週採樣兩次。這些隊列研究分別招募了南非的年輕女性以及肯亞和泰國的男性和女性，這些人感染愛滋病毒的可能性很高。在評估表現時，「真正的 DDA」是最後一次陰性和首次陽性 RNA 診斷測試之間的界限中心（中位數時間 4 天，範圍 2-7 天）；偏差是估計 DDA 與真實 DDA 之間的平均差異。僅使用診斷資料得出的時間估計偏差為 2.4 天，均方根誤差 (RMSE) 為 7.9 天。使用序列+診斷資料（偏差 1.5 天，RMSE 6.9 天）以及透過將基於序列的估計限制為 DDA 後 5 週以內的樣本（偏差 0.2 天，RMSE 7.8 天），這些結果得到了改善。重要性 在愛滋病毒預防試驗中，可以使用對個別參與者感染愛滋病毒時間的準確時間估計來估計感染時的抗體水平，這對於預測預防所需的抗體水平很有用。我們在此報告的結果表明，如果在未來針對 HIV 預防的聯合廣泛中和抗體 (bnAb) 方案或多特異性 bnAb 的臨床試驗中使用基於序列的採集時間估計，則需要至少每月一次的採樣頻率。此外，在此處分析的樣本中，我們觀察到 DDA 後 5 週內採集的樣本基於序列的時間估計偏差較小。這項觀察結果與免疫驅動的選擇壓力的時間一致，免疫驅動的選擇壓力可能會對檢測採集篩效應的能力產生負面影響。