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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2026-03-12
摘要
直系同源推論是比較基因體學研究的基礎。正確識別源自共同祖先序列的基因座不僅因序列分歧而變得複雜，而且因重複和其他基因組重排而變得複雜。基因順序的保守性，即同線性，與序列相似性結合使用，作為直系同源性確定的附加因素。然而，目前的方法依賴基因組註釋，因此受到限制。在這裡，我們提出了一種無註釋方法，並將其與帶註釋的同線性分析進行比較。我們發現我們的方法在密切相關的基因組中效果更好，而對於關係較遠的基因組進行註釋則有更好的性能。總的來說，所提出的演算法為基於註釋的方法提供了一種有用的替代方案，並且在許多情況下可以超越它們。