聖塔非研究所
GenomeHistory：軟體工具及其在全基因組定序中的應用
2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/18 下午06:11
摘要 我們提出了一種公開可用的軟體工具，可以定位基因組中所有重複基因對，然後確定每個重複基因對之間同義和非同義分歧的程度。使用這個工具，我們分析了（i）基因功能和基因複製傾向，以及（ii）基因家族中基因的數量和家族序列進化速率之間的關係。我們對四種真核生物（裂殖酵母、芽殖酵母、果蠅、線蟲）和一種原核生物（「大腸桿菌」）的完整基因組進行了這項研究。
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論文資訊
- 類型：工作論文
- 編號：工作論文 #712
- 日期：2026-03-18
摘要
我們提出了一種公開可用的軟體工具，可以定位基因組中所有重複基因對，然後確定每個重複基因對之間同義和非同義分歧的程度。使用這個工具，我們分析了（i）基因功能和基因複製傾向，以及（ii）基因家族中基因的數量和家族序列進化速率之間的關係。我們對四種真核生物（裂殖酵母、芽殖酵母、果蠅、線蟲）和一種原核生物（「大腸桿菌」）的完整基因組進行了這項研究。