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論文資訊
- 類型：工作論文
- 編號：工作論文 #392
- 日期：2026-03-18
摘要
RNA-RNA 相互作用的熱力學由兩個部分組成：使潛在結合區域可接近（即未配對）所需的能量，以及從兩個相互作用夥伴的鹼基配對中獲得的能量。我們在這裡展示了使用 RNAup 的改進變體可以有效地計算這兩個組件。然後將此方法應用於一組參與翻譯控制的細菌小RNA。在所有具有生物活性的 sRNA 標靶相互作用的情況下，RNAup 預測的標靶位點與文獻完全一致。除了預測標靶位點位置外，RNAup 還可用於確定 sRNA 作用模式。利用有關目標位點位置和 sRNA 結合導致的可及性變化的信息，我們可以區分翻譯的正調節因子和負調節因子。