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論文資訊
- 類型：工作論文
- 編號：工作論文 #1559
- 日期：2026-03-18
摘要
詳細研究了透過配分函數演算法（McCaskill，1990）獲得的 RNA 折疊景觀的統計特性。作為漢明距離函數的自由能對相關性被用作景觀崎嶇程度的測量。配分函數的計算包含有關作為溫度函數的整個二級結構係綜的信息，並且與傳統的最小自由能方法相比，為所有熱力學興趣量打開了大門。引入了結構係綜的度量距離，並計算了結構本身層級的配對相關性。正如基於最穩定的二級結構預測的景觀一樣，在完整的生物物理“GCAU”字母表上定義的景觀比僅限於純“GC”序列的景觀平滑得多，並且相關長度幾乎是鍊長度的恆定分數。多結構景觀的相關函數表現出增加的相關長度，特別是在熔化溫度附近。然而，對演化的主要影響是對有限族群的採樣的有效增加，其中每個序列探索多種結構。