聖塔非研究所

RNA的演化動力學和中性理論

2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/19 上午12:32

摘要 了解基因型和表型之間的關係對於理解演化動力學至關重要。 RNA 是一個極為簡單但極具啟發性的案例:基因型(序列)和表型(結構)是單一分子的不同面向。鑑於 RNA 序列在體外成功進化以優化複製率 [1, 2] 或執行識別 [3, 4] 以及催化任務 [5 8],通用 RNA 折疊特性對選擇動態的影響值得關注。我們研究了一組複製和突變 RNA 序列的電腦模型,這些序列受到二級…

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論文資訊

  • 類型:工作論文
  • 編號:工作論文 #1393
  • 日期:2026-03-18

摘要

了解基因型和表型之間的關係對於理解演化動力學至關重要。 RNA 是一個極為簡單但極具啟發性的案例:基因型(序列)和表型(結構)是單一分子的不同面向。鑑於 RNA 序列在體外成功進化以優化複製率 [1, 2] 或執行識別 [3, 4] 以及催化任務 [5-8],通用 RNA 折疊特性對選擇動態的影響值得關注。我們研究了一組複製和突變 RNA 序列的電腦模型,這些序列受到二級結構選擇的影響。顯性表型和適應性在長期停滯期之間經歷突然轉變。相反,在遺傳層面上,族群可以透過序列空間中沿著結構等效序列的擴展網絡的擴散過程來描述。種群具有複雜的精細結構,由許多分離良好的簇組成,這些簇獨立移動並經歷隨機選擇。目前的工作為分子演化中性理論所依據的假設和現象學提供了一個機械模型 [9, 10]。