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論文資訊
- 類型：工作論文
- 編號：工作論文 #1021
- 日期：2026-03-18
摘要
許多真核基因的轉錄是透過轉錄因子（TF）之間的相互作用來調節的。合作性可能是同型的，涉及僅一種轉錄因子與基因調控區域中的多個位點的結合。它也可能是異型的，涉及多個 TF 的結合。兩種類型的協同性都有一個共同點，即各自 TF 的結合位點形成緊密連接的“簇”，結合位點組通常比單獨偶然預期的更緊密地關聯。此特性可用於識別受一個或多個具有已知 DNA 結合特異性的 TF 調節的基因。提出了一種適用於識別整個真核基因組中具有統計顯著性的同型或異型 TF 結合位點簇的統計技術。 TF 結合位點簇的統計訊號以及簇附近基因的生化資訊可用於識別可能受 TF 調節的基因。該技術的應用以涉及酵母「釀酒酵母」細胞週期和交配控制的四種轉錄因子進行了說明，表明所獲得的結果具有生物學意義。這種產生基因調控假設的快速且廉價的計算方法因此產生可用於指導後續昂貴且費力的實驗方法的資訊。它可能有助於發現已知功能的基因之間的相互作用，以及將生物功能分配給假定的開放閱讀框。