聖塔非研究所

並行計算機上的 RNA 折疊

2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/19 上午12:12

摘要 二級結構預測是 RNA 序列分析的標準工具。 RNA 二級結構的預測本質上是非局部的。這使得長序列(超過 4000 個核苷酸)的分析在當今的工作站上變得不可行。超立方型平行計算機的二級結構預測演算法的實現可以有效地計算完整 RNA 病毒基因組的結構,例如 HIV 1 和其他慢病毒。

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論文資訊

  • 類型:工作論文
  • 編號:工作論文 #1308
  • 日期:2026-03-18

摘要

二級結構預測是 RNA 序列分析的標準工具。 RNA 二級結構的預測本質上是非局部的。這使得長序列(超過 4000 個核苷酸)的分析在當今的工作站上變得不可行。超立方型平行計算機的二級結構預測演算法的實現可以有效地計算完整 RNA 病毒基因組的結構,例如 HIV-1 和其他慢病毒。