聖塔非研究所

催化的分子演化

2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/18 下午11:16

摘要 在本文中,我們考慮具有獨特基因型 表型關係的催化活性物種的演化動力學。 RNA 分子的摺疊景觀是這種與基本中性特性關係的範例。這種景觀本身是由表型(實現為二級結構)劃分的。每個基因型(表示為序列)都以獨特的方式分配一個結構。映射到特定結構的所有序列的集合被建模為序列空間中的隨機圖(所謂的神經網路)。催化網絡被實現為具有最大出度2和二級結構作為頂點集的隨機有向圖。與確定性描…

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論文資訊

  • 類型:工作論文
  • 編號:工作論文 #1135
  • 日期:2026-03-18

摘要

在本文中,我們考慮具有獨特基因型-表型關係的催化活性物種的演化動力學。 RNA 分子的摺疊景觀是這種與基本中性特性關係的範例。這種景觀本身是由表型(實現為二級結構)劃分的。每個基因型(表示為序列)都以獨特的方式分配一個結構。映射到特定結構的所有序列的集合被建模為序列空間中的隨機圖(所謂的神經網路)。催化網絡被實現為具有最大出度2和二級結構作為頂點集的隨機有向圖。與確定性描述相比,研究一組催化 RNA 分子顯示出顯著不同的行為:超循環能夠共存並存活。具有卓越催化支持的寄生蟲。可以觀察到網路的不同動態組織之間的“切換”,可以報告超循環組織針對錯誤的動態穩定性以及催化錯誤閾值的存在。