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論文資訊
- 類型：工作論文
- 編號：工作論文 #1142
- 日期：2026-03-18
摘要
噬菌體展示、SELEX 和其他組合化學方法已成為尋找與給定標靶具有高親和力的配體的非常流行的方法。儘管取得了成功，但它們仍存在許多誤差和偏差來源，例如物種初始濃度非常低、非特異性結合以及在實驗結束時僅對文庫的一小部分進行採樣。為了了解這些錯誤的相互作用並更好地設計考慮到錯誤的分子搜尋策略，我們設計並分析了高度詳細的噬菌體展示模型。該模型專門設計用於研究每個實驗室步驟的隨機性質的影響。該模型包括噬菌體多價性、多類標靶以及固相平衡和洗滌，但它適合分析結果和快速電腦模擬。透過分析和模擬方法，我們（1）描述了靶濃度、噬菌體效價、背景結合程度和其他實驗室參數對噬菌體結合和被選擇概率的影響； (2) 顯示增加選擇嚴格性策略的效果，以及它如何導致快速文庫富集和採樣最佳配體的高概率之間的權衡； (3) 顯示在搜索結束時為詳細研究而採樣最佳配體的高概率之間的權衡； (3) 顯示在搜索結束時為詳細研究而採樣的數量如何改變。