聖塔非研究所

基因簇的擴展、循環順序和最短哈密頓路徑問題

2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/18 上午11:37

摘要 抽象的 。旁系同源基因簇,例如著名的發育轉錄因子 HOX 簇,往往透過其成員的逐步複製而進化,通常涉及不等的交叉。基因轉換和可能的其他協同演化機制進一步混淆了系統發育關係。因此,解開基因簇中基因重複的詳細歷史是非常困難的,甚至是不可能的。在這篇文章中,我們表明,沃爾特·格林提出的通過不等交叉的基因簇擴展導致了遺傳距離的獨特模式,即圓形分裂系統的一個子類。此外,當基因簇不受…

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論文資訊

  • 類型:工作論文
  • 編號:工作論文 #24
  • 日期:2026-03-18

摘要

抽象的 。旁系同源基因簇,例如著名的發育轉錄因子 HOX 簇,往往透過其成員的逐步複製而進化,通常涉及不等的交叉。基因轉換和可能的其他協同演化機制進一步混淆了系統發育關係。因此,解開基因簇中基因重複的詳細歷史是非常困難的,甚至是不可能的。在這篇文章中,我們表明,沃爾特·格林提出的通過不等交叉的基因簇擴展導致了遺傳距離的獨特模式,即圓形分裂系統的一個子類。此外,當基因簇不受基因組重排幹擾時,最短哈密頓路徑 w.r.t.遺傳距離與基因組順序一致。這項觀察結果可用於檢測基因簇的古代基因組重排,並區分其進化由基因內不平等交叉主導的基因簇與其他機制擴展的基因簇。