聖塔非研究所

基因組架構中的「免費」模組化

2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/18 下午05:16

摘要 最近的基因組 蛋白質組演化模型表明,細胞網絡整體結構所表現出的一些關鍵特徵可能是複製多樣化(DD)過程的自然結果。這種進化的後果之一是出現了小世界架構以及無標度的交互分佈。在這裡,我們表明出現這種結構的參數空間域與相變現像有關。在這個轉變點,模組化架構作為 DD 過程的副產品會自發性出現。儘管 DD 模型缺乏任何功能,因此不受功能限制,但當調整到接近將高度連接的圖與斷開的…

本頁只刊出中文翻譯與中文說明;英文原文請見下方原文連結。

原文連結

論文資訊

  • 類型:工作論文
  • 編號:工作論文 #615
  • 日期:2026-03-18

摘要

最近的基因組-蛋白質組演化模型表明,細胞網絡整體結構所表現出的一些關鍵特徵可能是複製多樣化(DD)過程的自然結果。這種進化的後果之一是出現了小世界架構以及無標度的交互分佈。在這裡,我們表明出現這種結構的參數空間域與相變現像有關。在這個轉變點,模組化架構作為 DD 過程的副產品會自發性出現。儘管 DD 模型缺乏任何功能,因此不受功能限制,但當調整到接近將高度連接的圖與斷開的系統分開的尖銳過渡點時,它們顯示了真實蛋白質組圖譜顯示的觀察到的特徵。靠近這樣的邊界,地圖顯示出無標度的層次結構,表現為小世界,並表現出模組化。據推測,自然選擇調整了平均連接性,使網路達到稀疏的連接圖。這種情況的一個後果是,縮放定律和建構模組化網路的基本要素在接近這種轉變時出現{\em免費}。