聖塔非研究所

基因與基因組概念:編碼與調控-根據現代分子生物學對遺傳儲存與表現進行概念與資訊理論分析

2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/18 下午03:39

摘要 我們在此分析基因的定義,以便根據現代分子生物學的見解來區分基因編碼的內容,即特定的多肽,以及其表達是如何實現和控制的。在DNA的編碼作用被發現之前,一個基因被鑑定為具有特定的表型特徵,從孟德爾到摩根再到本澤。然而,隨後,分子生物學家冒險在 DNA 序列層面上根據編碼定義基因。越來越明顯的是,DNA層面儲存的資訊與功能產品之間的關係非常複雜,監管方面與產品的資訊編碼一樣重要…

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論文資訊

  • 類型:工作論文
  • 編號:工作論文 #447
  • 日期:2026-03-18

摘要

我們在此分析基因的定義,以便根據現代分子生物學的見解來區分基因編碼的內容,即特定的多肽,以及其表達是如何實現和控制的。在DNA的編碼作用被發現之前,一個基因被鑑定為具有特定的表型特徵,從孟德爾到摩根再到本澤。然而,隨後,分子生物學家冒險在 DNA 序列層面上根據編碼定義基因。越來越明顯的是,DNA層面儲存的資訊與功能產品之間的關係非常複雜,監管方面與產品的資訊編碼一樣重要且必要。因此,這種方法導致了概念上的混合,混淆了編碼、監管和功能方面。在本文中,我們再次從功能方面出發對基因進行了定義。細胞功能可以由多肽或RNA代表。就多肽而言,其生化特性由翻譯前的 mRNA 決定,這就是我們定位基因的地方。然後可以根據調控分析從 DNA 水平上特定但可能分離的序列片段到最終 mRNA 的步驟。為此,我們創造了新術語“genon”。透過這種方式,我們可以清楚地區分產品和監管訊息,同時保持編碼和功能之間的基本關係,而無需引入概念混合。在 mRNA 中,調節基因表現的程序被疊加並添加到順式編碼序列上——我們稱之為基因組。反式作用因子對給定 mRNA 的互補外部控制被納入其轉基因子。這項定義的結果是,在真核生物中,大多數情況下,該基因尚不存在於 DNA 層面。相反,它是透過 RNA 加工(包括差異剪接)從各個片段組裝而成,由基因組控制。它最終在翻譯之前在mRNA水平上以不間斷的核酸序列出現,與要作為多肽產生的氨基酸序列忠實對應。翻譯完成後,基因就完成了它的作用並到期。最終多肽中具體化的蛋白質編碼訊息與基因組代表的加工資訊之間的差異使我們能夠建立一個新的資訊理論方案。由遺傳密碼確定的標準序列資訊表達了編碼序列與產物之間的關係。逆向分析詢問給定的多肽源自 DNA 中的哪個編碼區。 (更有趣的)正向分析詢問給定 DNA 片段表達了多少種不同類型的多肽。這涉及到我們引入基因組概念的表達過程的控制。因此,資訊理論分析可以捕捉基因和基因組的編碼和調控的互補方面。