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論文資訊
- 類型：工作論文
- 編號：工作論文 #372
- 日期：2026-03-18
摘要
無論基因組極性如何，在病毒複製過程中，必須合成互補正義的中間體，並將其用作合成新基因組鏈的模板。根據新合成的基因組分子是否成為產生額外反基因組鏈的模板，從而產生幾何增長，或者僅使用首先合成的反基因組鏈來達到此目的，因此遵循Luria的沖壓機模型，突變基因組的豐度和分佈將有所不同。病毒複製的數學模型在很大程度上忽略了這一事實，並且通常假設純粹的幾何增長。在這裡，我們提出了數學和位串準種模型，可以區分線性複製和幾何複製，並且還考慮了複製的反基因組中間體的存在。我們觀察到，隨著複製機制從純幾何切換到沖壓機器，誤差閾值會增加。我們也發現，對於大範圍的突變率，無論複製方案如何，大效應突變都不會累積。然而，輕微的突變效應在幾何模式下累積得更多。此外，在高突變率下，幾何成長會導致突變效應中間值的群體更快崩潰，在該值下，沖壓機仍然產生非突變基因組。最後，隨著突變率的增加，接近線性複製和高複製酶產量的病毒體產量最高。總之，我們已經證明，透過選擇沖壓機複製策略，RNA病毒可以增強其抵抗有害突變累積的穩健性。