聖塔非研究所

從序列到形狀再回傳:RNA 二級結構的案例研究

2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/19 上午01:25

摘要 RNA 折疊被視為將二級結構分配給序列的圖譜。在固定鍊長度下,序列的數量遠遠超過結構的數量。結構的頻率高度不均勻:我們發現常見的結構相對較少,而罕見的結構則有許多。使用逆折疊演算法,我們表明共享相同結構的序列在序列空間上隨機分佈。所有常見的結構都可以透過許多遠小於鍊長的突變從任意序列存取。進化優化只需搜尋所有序列的一小部分即可找到合適的目標結構,因此很難錯過它。序列空間由…

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論文資訊

  • 類型:工作論文
  • 編號:工作論文 #1494
  • 日期:2026-03-18

摘要

RNA 折疊被視為將二級結構分配給序列的圖譜。在固定鍊長度下,序列的數量遠遠超過結構的數量。結構的頻率高度不均勻:我們發現常見的結構相對較少,而罕見的結構則有許多。使用逆折疊演算法,我們表明共享相同結構的序列在序列空間上隨機分佈。所有常見的結構都可以透過許多遠小於鍊長的突變從任意序列存取。進化優化只需搜尋所有序列的一小部分即可找到合適的目標結構,因此很難錯過它。序列空間由廣泛的神經網路滲透,連接最近的鄰居折疊成相同的結構。