聖塔非研究所

溶劑暴露對一系列酵母蛋白產生類似的選擇壓力

2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/18 下午02:53

摘要 我們透過分析晶體結構已知的 61 個酵母基因的多重比對,研究胺基酸殘基的溶劑暴露如何影響其取代傾向。我們發現內部殘基的選擇性約束平均是表面殘基的十倍。令人驚訝的是,觀察到的蛋白質比對的整體選擇性約束與內部和表面殘基的約束比率之間沒有相關性。透過對幾種氨基酸特性的選擇性約束進行建模,我們表明,雖然殘基體積和親水性在大多數比對中都非常保守,但這兩種特性的內部與表面保守性幾乎沒…

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論文資訊

  • 類型:工作論文
  • 編號:工作論文 #358
  • 日期:2026-03-18

摘要

我們透過分析晶體結構已知的 61 個酵母基因的多重比對,研究胺基酸殘基的溶劑暴露如何影響其取代傾向。我們發現內部殘基的選擇性約束平均是表面殘基的十倍。令人驚訝的是,觀察到的蛋白質比對的整體選擇性約束與內部和表面殘基的約束比率之間沒有相關性。透過對幾種氨基酸特性的選擇性約束進行建模,我們表明,雖然殘基體積和親水性在大多數比對中都非常保守,但這兩種特性的內部與表面保守性幾乎沒有變化。相較之下,當將蛋白質視為一個整體時,殘基電荷(等電點)通常不太保守,但對將帶電殘基引入蛋白質內部顯示出強烈的限制。