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論文資訊
- 類型：工作論文
- 編號：工作論文 #1277
- 日期：2026-03-18
摘要
系統地研究了基於不同折疊標準（最小自由能（mfe）、動力學折疊（kin）、最大匹配（mm））和不同參數集預測RNA二級結構的演算法。使用兩種鹼基配對字母表：二元 GC 和自然四字母 AUGC 字母表。計算的結構和自由能很大程度上取決於演算法和參數集。統計特性，例如鹼基對的平均數、堆疊的平均數、平均環大小等，對參數集甚至演算法的選擇較不敏感。 RNA二級結構的一些特徵，如結構相關函數、形狀空間覆蓋和中性網絡，似乎只取決於鹼基配對邏輯（GC或AUGC字母）。