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論文資訊
- 類型：工作論文
- 編號：工作論文 #1116
- 日期：2026-03-18
摘要
適應度景觀是分子演化中的一個重要概念，因為演化適應以及生物分子的體外選擇可以被視為類似爬山的過程。景觀的全局特徵可以透過統計測量來描述，例如相關函數或中性（同等擬合）鄰居的比例。從統計物理學中藉用的簡單的旋轉玻璃狀景觀模型有助於進行詳細的數學分析，但缺乏自然景觀的幾個基本特徵。生物學相關的景觀模型基於這樣的假設：基因型產生表型，表型由其環境評估，從而確定基因型的適應性。在生物聚合物的體外演化的情況下，表型是分子的三維形狀。很大程度的中性性，產生中性網絡和形狀空間覆蓋，是RNA和多肽序列結構圖的一般特徵。這些屬性由適應度景觀繼承，與結構適應度評估的細節無關。中立性從本質上改變了演化的動力。雖然沒有中立鄰居的崎嶇景觀會導致局部種群，陷入局部最優，並且存在臨界複製率，超過該複製率序列資訊就會丟失，但我們發現序列空間中的擴散以及由RNA或蛋白質折疊產生的新突變體在景觀上的持久創新。