聖塔非研究所

病毒靶向的擬南芥互作組的表徵

2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/18 下午01:42

摘要 由於涉及因素的多樣性和相互作用的複雜性,了解植物觸發宿主防禦病毒的機制一直是一個具有挑戰性的問題。然而,基因組技術的出現為掌握交互作用的全局圖景提供了可能性。在這裡,我們使用擬南芥來識別和比較在七種不同的 (+)ssRNA 和一種 ssDNA 植物病毒感染時受到差異調節的基因。在第一種方法中,我們建立了受每種病毒不同影響的基因列表,並比較了它們對生物功能和代謝過程的參與。…

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論文資訊

  • 類型:工作論文
  • 編號:工作論文 #233
  • 日期:2026-03-18

摘要

由於涉及因素的多樣性和相互作用的複雜性,了解植物觸發宿主防禦病毒的機制一直是一個具有挑戰性的問題。然而,基因組技術的出現為掌握交互作用的全局圖景提供了可能性。在這裡,我們使用擬南芥來識別和比較在七種不同的 (+)ssRNA 和一種 ssDNA 植物病毒感染時受到差異調節的基因。在第一種方法中,我們建立了受每種病毒不同影響的基因列表,並比較了它們對生物功能和代謝過程的參與。我們發現,系統發育相關的病毒顯著改變相似基因的表達,而自然感染十字花科的病毒在植物反應中表現出更大的重疊。在第二種方法中,使用擬南芥的轉錄和蛋白質-蛋白質交互作用網絡對病毒調節基因進行背景化。我們的結果證實,宿主細胞在感染過程中對其轉錄組進行了顯著的重編程,這可能是建立宿主防禦的核心要求。我們發現了一種一般的作用模式,其中擾動優先影響高度連接、集中和組織在模組中的基因。這表明從病毒效應子到免疫反應基因的訊息傳輸存在冗餘,並使我們能夠認為這種中樞蛋白的過度觸發是一種賦予宿主防禦表達穩健性的機制。