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論文資訊
- 類型：工作論文
- 編號：工作論文 #589
- 日期：2026-03-18
摘要
保守非編碼序列 (CNS) 是基因組中的保守序列，通常包含順式調控元件，例如轉錄因子結合位點。 KCNK 基因家族蛋白代表了幾乎所有在後生動物細胞類型中發現的古老離子調節系統。透過使用結構/生物物理標準衍生出該家族的一組保守的 33 個基因。在這裡，我們研究了該家族中秀麗隱桿線蟲和布里格線蟲基因組比對衍生的 CNS 的分佈和流行率，其中包括超過 350 個區域（內含子和基因間）的超過 300 kb 的非編碼 DNA (ncDNA)。整體而言，每個基因約有 14 個 CNS，約 10% 的 ncDNA 核苷酸位於 CNS 中。很大一部分 CNS (~30%) 在內含子中發現，大多數基因至少擁有一個內含子 CNS。一般來說，CNS在空間上聚集，GC含量高於CNS以外的ncDNA，並且表現出顯著的轉變偏差。對於內含子和基因間區域，CNS 的標準化盛行率相似，透過 ncDNA 的覆蓋百分比和每 kb ncDNA 的 CNS 數量來衡量，並且 CNS 盛行率與區域長度相關。內含子 CNS 優先分佈在基因的 5' 端，在較小程度上分佈在基因的 3' 端，中間內含子的數量明顯較少。這些結果表明，內含子 CNS 構成了秀麗隱桿線蟲 CNS 的主要群體—C. elegans。 briggsae 以及控制內含子和基因間 CNS 的過程可能是相似的。