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論文資訊
- 類型：工作論文
- 編號：工作論文 #1087
- 日期：2026-03-18
摘要
我們提出了一種檢測相關 RNA 序列家族中保守 RNA 二級結構的新方法。我們的方法是基於熱力學結構預測和系統發育比較的組合。與純粹的系統發育方法相比，我們的演算法可用於大約十個序列的小資料集，有效地利用序列變異性中包含的資訊。該過程僅對與單一保守結構一致的序列部分建構預測。我們的實現產生了合理的共識結構，無需用戶幹預。例如，我們分析了完整的 HIV-1 和丙型肝炎病毒基因組以及漢塔病毒的一小部分。我們的方法證實了 HIV-1 中的已知結構，並預測了 HCV 中先前未知的保守 RNA 二級結構。