本頁只刊出中文翻譯與中文說明；英文原文請見下方原文連結。
原文連結
論文資訊
- 類型：工作論文
- 編號：工作論文 #1112
- 日期：2026-03-18
摘要
RNA 分子比對序列組的協變分析在闡明 RNA 二級結構以及三級結構的某些方面相對成功[Gutell(1992)]。蛋白質分子比對序列組的共變分析在某些情況下成功地闡明了某些結構和功能連結[Korber(1993)]，但一般來說，蛋白質序列中顯示高度共變突變的位點對不一定對應於蛋白質結構中空間上接近的位點[Gobel(1994)]、[Clark(1995)]、Shindya、[1995)] [泰勒（1994）]，[內爾（1994）]。在本文中，我們確定了對蛋白質序列簡單使用協變分析無法可靠地指示空間上鄰近的序列位置的兩個原因。第一個原因涉及在計算共變測量時引入的偏差，這是由於生物序列通常透過非平凡的系統發育樹相關的事實。我們提出了一種零模型方法來解決這個問題。第二個原因涉及共變的連結鏈，這可能導致成對的位點顯示出顯著的共變，即使它們在空間上並不接近。我們針對「因果關係與相關性」這個經典問題提出了最大熵解決方案。這些方法在模擬中得到驗證。