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論文資訊
- 類型:工作論文
- 編號:工作論文 #1015
- 日期:2026-03-18
摘要
基於條件機率的標準與演算法距離的概念相關,用於檢測序列上不連續位點的相關突變。我們將此標準應用於分析蛋白質序列中位點之間的相關性的問題,但是,該分析通常適用於每個位點具有離散狀態的相互作用位點的網絡。介紹了可以輕鬆得出明確結果的基本模型。每個位點考慮的狀態數範圍從兩個(說明與熟悉的經典自旋系統的關係)到二十個狀態(適合代表胺基酸)。數值模擬表明,即使當資料樣本(例如蛋白質序列)的遺傳歷史(如係統發育樹所示)引入樣本之間的非獨立性時,該標準仍然有效。也研究了有限抽樣引起的統計波動,並且不會使標準失效。也發現了一個附屬結果:種群越同質,其平均屬性就越容易偏離其祖先的屬性。