聖塔非研究所

訊號傳導和轉錄調控網路中的最長路徑和週期:自然選擇的特徵?

2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/18 下午04:54

摘要 我們詢問自然選擇是否塑造了 15 個訊號傳導網絡和 2 個基因組規模轉錄調控網絡的三個生物學重要特徵。這些特徵是調節週期、通過網路的最長路徑的長度(網路緊湊性的度量)以及由許多替代調節路徑連接的節點對的豐富度。我們確定這些特徵在生物網路中是否比在每個網路節點的傳入和傳出連接分佈相同的隨機網路中顯著更多或更少。我們發現轉錄調控網絡中的自動調節循環異常豐富。然而,在幾個訊號轉…

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論文資訊

  • 類型:工作論文
  • 編號:工作論文 #577
  • 日期:2026-03-18

摘要

我們詢問自然選擇是否塑造了 15 個訊號傳導網絡和 2 個基因組規模轉錄調控網絡的三個生物學重要特徵。這些特徵是調節週期、通過網路的最長路徑的長度(網路緊湊性的度量)以及由許多替代調節路徑連接的節點對的豐富度。我們確定這些特徵在生物網路中是否比在每個網路節點的傳入和傳出連接分佈相同的隨機網路中顯著更多或更少。我們發現轉錄調控網絡中的自動調節循環異常豐富。然而,在幾個訊號轉導網路中,所有其他循環的豐富程度都明顯較低。這表明網路中複雜的反饋迴路引起的多穩定性可能會幹擾此類網路的功能。我們還發現,我們檢查的幾個網路比偶然預期的更緊湊。這提出了這樣的可能性:透過此類網路的資訊傳輸(在緊湊網路中速度最快)是此類網路的生物學重要特徵。