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論文資訊
- 類型：工作論文
- 編號：工作論文 #859
- 日期：2026-03-18
摘要
隨著 DNA 雜交微陣列的出現，原則上具有同時監測大量基因表現量的卓越能力。兩個或多個微陣列的定量比較可以揭示例如定義不同細胞表型的基因表現的不同模式或在細胞對損傷或變化的環境條件的反應中誘導的基因。測量強度的標準化是這種比較的先決條件，實際上也是任何統計分析的先決條件，但很少有人關注其係統研究。使用的最直接的歸一化技術依賴於真實表達水平和輸出強度之間線性響應的隱含假設。我們發現這些假設並不普遍滿足，而這些簡單的方法可以改進。我們開發了一種強大的半參數標準化技術，該技術基於以下假設：絕大多數基因的相對錶達水平不會從一個治療組到下一個治療組發生變化，並且假設線性響應的偏差很小且變化緩慢。我們使用局部迴歸來估計標準化表現量以及與表現量相關的誤差。我們透過比較在對照和溴酸鉀處理下培養的大鼠間皮瘤細胞的表達譜來說明該技術的用途，並使用對選定的一組基因進行定量 PCR 進行驗證。我們使用在各種誤差模型下模擬的數據測試了該方法，發現它表現良好。