聖塔非研究所

酵母轉錄調控網絡中的分子演化

2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/18 下午05:07

摘要 我們分析了染色質免疫沉澱實驗所揭示的酵母轉錄調控網絡的結構,並表徵了其轉錄調控因子及其目標(調控)基因的分子演化。我們檢驗了高度連結的基因對於基因網路的功能更重要的假設。網絡基因的分子進化速率、網絡基因進行基因複製的速率以及網絡基因中合成無效突變的影響這三個證據並沒有為此假設提供強有力的支持。此外,我們也詢問網絡基因在複製後的轉錄調控上如何發生分歧。轉錄因子結合的喪失(亞…

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論文資訊

  • 類型:工作論文
  • 編號:工作論文 #601
  • 日期:2026-03-18

摘要

我們分析了染色質免疫沉澱實驗所揭示的酵母轉錄調控網絡的結構,並表徵了其轉錄調控因子及其目標(調控)基因的分子演化。我們檢驗了高度連結的基因對於基因網路的功能更重要的假設。網絡基因的分子進化速率、網絡基因進行基因複製的速率以及網絡基因中合成無效突變的影響這三個證據並沒有為此假設提供強有力的支持。此外,我們也詢問網絡基因在複製後的轉錄調控上如何發生分歧。轉錄因子結合的喪失(亞功能化)和獲得(新功能化)都在這種分歧中發揮作用,而且這種分歧往往很快。一方面,基因複製會經歷與其結合的轉錄因子數量的淨損失,這表明基因複製後失去轉錄因子結合位點的重要性。另一方面,如果結合喪失是重複基因差異的唯一原因,則與高度分化的重複基因結合的轉錄因子的數量顯著大於預期。