聖塔非研究所

重複基因的不對稱序列分歧

2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/18 下午05:33

摘要 就像人類一樣,基因複製品可能生來平等,但這種狀態不會持續太久。我們在這裡展示了四個完全定序的基因組,20 30% 的重複基因對在其蛋白質產物的氨基酸序列中顯示不對稱進化。也就是說,其中一個複製品的演化速度比另一個要快得多。這種不對稱性越大,基因對中氨基酸取代 (Ka) 與沉默取代 (Ks) 的 Ka/K 比率就越大。這表明大多數不對稱分歧可能是由於對重複之一的選擇性約束放…

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論文資訊

  • 類型:工作論文
  • 編號:工作論文 #647
  • 日期:2026-03-18

摘要

就像人類一樣,基因複製品可能生來平等,但這種狀態不會持續太久。我們在這裡展示了四個完全定序的基因組,20-30% 的重複基因對在其蛋白質產物的氨基酸序列中顯示不對稱進化。也就是說,其中一個複製品的演化速度比另一個要快得多。這種不對稱性越大,基因對中氨基酸取代 (Ka) 與沉默取代 (Ks) 的 Ka/K 比率就越大。這表明大多數不對稱分歧可能是由於對重複之一的選擇性約束放寬造成的。然而,我們也發現一些候選重複,其中有益突變的正向(定向)選擇(Ka/Ks > 1)可能在不對稱分歧中發揮作用。我們的分析基於基於密碼子的分子演化模型,該模型允許測試 Ka 的不對稱分歧。此方法在檢測正向選擇 (Ka/Ks > 1) 方面也比僅依賴成對基因比較的模型更敏感。