聖塔非研究所

體細胞超突變下 V 基因的遺傳可塑性:使用基於重採樣的新方法進行統計分析

2026-03-18 · 工作論文 · 更新 2026/03/18 下午09:03

摘要 在所有發現免疫球蛋白的物種中都觀察到了免疫球蛋白基因體細胞超突變的證據。先前的研究表明,Ig V 基因中的密碼子使用使得體細胞超突變的序列特異性導致基因的互補性決定區比框架區具有更大的突變性。我們開發了一種新的基於重採樣的方法,以具有統計意義的方式探索單一 V 基因和 V 基因家族的遺傳可塑性。我們確定哪些因素導致了這種變異性差異,並表徵了這種效應的選擇強度。我們發現,儘…

本頁只刊出中文翻譯與中文說明;英文原文請見下方原文連結。

原文連結

論文資訊

  • 類型:工作論文
  • 編號:工作論文 #975
  • 日期:2026-03-18

摘要

在所有發現免疫球蛋白的物種中都觀察到了免疫球蛋白基因體細胞超突變的證據。先前的研究表明,Ig V 基因中的密碼子使用使得體細胞超突變的序列特異性導致基因的互補性決定區比框架區具有更大的突變性。我們開發了一種新的基於重採樣的方法,以具有統計意義的方式探索單一 V 基因和 V 基因家族的遺傳可塑性。我們確定哪些因素導致了這種變異性差異,並表徵了這種效應的選擇強度。我們發現,儘管 Ig V 基因中的密碼子使用使得它們在具有隨機密碼子使用的翻譯等價序列中有所不同,但它們在這方面仍然遠非最佳。我們發現許多物種的突變模式與我們在人類序列中發現的相似。有趣的是,綿羊序列顯示出極強的突變性差異,這與體細胞超突變作為這些動物主要多樣化的作用一致。人類 TCR V$_beta$ 序列在突變模式中與 Ig 相似,這表明了幾種替代方案之一:超突變在 TCR 中發揮功能;它曾經在 TCR 或 TCR 和 Ig 的共同前體中運行;或者超突變機制已經進化到利用 Ig 中的密碼子使用(以及偶然的 TCR),而不是反之亦然。